Née dans une famille de sportifs, elle est fille du footballeur Lei Clijsters et de la championne de gymnastique, Els Vandecaetsbeek.
Dés 6 ans, elle rejoint le club « Diest » et ensuite le club d’entrainement Vlaams-tennis vereniging. Elle débute sa carrière dans le tennis en 1997 et met fin à sa deuxième carrière lors de l’US Open 2012. Après 7 ans d’absence, en 2019, elle affirme sont retour pour 2022, malheureusement le Covid lui empêche un retour en force.
Durant sa carrière, elle a remporté 41 tournois, est qualifieée 8 fois « sportive belge de l’année » et est la première à avoir gagné le mondial. Lors de sa victoire à l’US Open en 2005, elle reçoit le plus gros chèque de l’histoire du sport féminin s’élevant à 2,2 millions de dollars.
Elle se retire de son circuit professionnel en avril 2022. Elle joue maintenant au Pickleball ; sport de raquette inspiré du tennis. Elle le pratique majoritairement aux Etats-Unis.